MAFEX fue creada el 16 de septiembre de 2004 en Madrid, con el apoyo de 13 empresas españolas del sector y de organizaciones como ICEX - España, Exportación e Inversiones, RENFE (actualmente dividido en RENFE y ADIF) y ADAF (actualmente CETREN).
En la actualidad la MAFEX cuenta con 73 empresas asociadas.
La Asociación pertenece al GRUPO AGEX, que agrupa también a otras tres asociaciones sectoriales de diversos sectores industriales de exportadores españoles, todas ellas dedicadas desde hace más de 35 años a promover la internacionalización de sus empresas asociadas. Estas cuatro asociaciones son:
AGRAGEX (maquinaria agrícola)
FUNDIGEX (fundición)
SIDEREX (siderurgia)
En el año 2005 MAFEX pone en marcha su primer plan sectorial de acciones de promoción exterior para el sector ferroviario en colaboración con el ICEX - España, Exportación e Inversiones.
La asociación es reconocida en 2007 como Entidad Oficial Colaboradora del MINISTERIO DE COMERCIO, INDUSTRIA Y TURISMO a través de la Subsecretaría de Comercio.
Ya en 2007 MAFEX se asocia a UNIFE (Unión Internacional de Industrias Ferroviarias) pasando a representar a la industria ferroviaria española en el comité de asociaciones nacionales de dicha organización.
En 2010 MAFEX firma un acuerdo de colaboración con ALAMYS - Asociación Latinoamericana de Metros y Subterráneos.